通常情況下，大部分試點(diǎn)的企業(yè)由營業(yè)稅納稅人轉(zhuǎn)變?yōu)樵鲋刀惣{稅人基本上和現(xiàn)行的增值稅規(guī)定和相關(guān)的處理方法一致，其中最基本的特征是按照當(dāng)期應(yīng)稅服務(wù)銷售額（不含稅）和適用的增值稅率計(jì)算增值稅銷項(xiàng)稅額，在扣除當(dāng)期購買的應(yīng)稅產(chǎn)品和服務(wù)的進(jìn)項(xiàng)稅額后，凈額為應(yīng)向稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)和繳納的當(dāng)期增值稅應(yīng)納稅額。另外，對(duì)于那些達(dá)不到一般納稅人條件的小規(guī)模試點(diǎn)企業(yè)，增值稅的征收率為3%，不得抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額，其處理方法和現(xiàn)行增值稅制度下對(duì)小規(guī)模納稅人的處理方法一致。

    金融服務(wù)、不動(dòng)產(chǎn)和建筑業(yè)、保險(xiǎn)服務(wù)和郵電通信服務(wù)不包含在本次試點(diǎn)范圍內(nèi)，將仍舊適用于繳納營業(yè)稅，但是，值得注意的是，未來金融保險(xiǎn)業(yè)和生活性服務(wù)業(yè)將很可能適用增值稅的簡(jiǎn)易計(jì)稅方法。

    這里值得注意的是，大部分試點(diǎn)企業(yè)都將受益于本次改革而不同程度的降低稅負(fù)。但對(duì)于交通運(yùn)輸業(yè)來講，適用的增值稅率為11%，目前交通運(yùn)輸業(yè)的營業(yè)稅率為3%，同時(shí)增值稅一般納稅人可以依照有關(guān)規(guī)定按7%的扣除率計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額，這樣來看，交通運(yùn)輸業(yè)的實(shí)際稅負(fù)似乎上升了。增值稅一般納稅人接受試點(diǎn)納稅人中的小規(guī)模納稅人提供的交通運(yùn)輸服務(wù)，可以按照7%的扣除率計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額，另外，試點(diǎn)納稅人中的一般納稅人提供的交通運(yùn)輸服務(wù)（包括輪客渡、公交客運(yùn)、軌道交通、出租車），可以選擇按照簡(jiǎn)易計(jì)算方法計(jì)算繳納增值稅。

    應(yīng)稅服務(wù)的認(rèn)定

    由于本次試點(diǎn)的城市為上海，所以如何明確應(yīng)稅服務(wù)的區(qū)域?qū)⒊蔀楸敬味惛膮^(qū)分應(yīng)稅服務(wù)繳納增值稅還是營業(yè)稅的一個(gè)重要問題。

    從上表我們可以看到，如果企業(yè)機(jī)構(gòu)在上海從事上述所列試點(diǎn)服務(wù)的，則其“機(jī)構(gòu)所在地”會(huì)被認(rèn)定為上海，其提供的應(yīng)稅服務(wù)將繳納增值稅，對(duì)于同一法人實(shí)體存在多個(gè)機(jī)構(gòu)，其中的一些機(jī)構(gòu)可能需要繳納增值稅（即機(jī)構(gòu)所在地在上海），而另一些機(jī)構(gòu)仍舊繳納營業(yè)稅（即機(jī)構(gòu)所在地在中國大陸其他地區(qū)）。盡管如此，這些法規(guī)在確定勞務(wù)發(fā)生地的問題上還存在很多問題，特別在電子商務(wù)中顯得特別突出。