３.提供生物技術時附帶提供的微生物菌種母本和動、植物新品種，應包括在免征營業(yè)稅的營業(yè)額內(nèi)。但批量銷售的微生物菌種，應當征收增值稅。
     （三）免稅的審批程序
     １.納稅人從事技術轉(zhuǎn)讓、開發(fā)業(yè)務申請免征營業(yè)稅時，須持技術轉(zhuǎn)讓、開發(fā)的書面合同，到納稅人所在地省級科技主管部門進行認定，再持有關的書面合同和科技主管部門審核意見證明報當?shù)厥〖壷鞴芏悇諜C關審核。
     外國企業(yè)和外籍個人從境外向中國境內(nèi)轉(zhuǎn)讓技術需要免征營業(yè)稅的，需提供技術轉(zhuǎn)讓或技術開發(fā)書面合同、納稅人或其授權人書面申請以及技術受讓方所在地的省級科技主管部門審核意見證明，經(jīng)省級稅務主管機關審核后，層報國家稅務總局批準。①
     ２.在科技和稅務部門審核批準以前，納稅人應當先按有關規(guī)定繳納營業(yè)稅，待科技、稅務部門審核后，再從以后應納的營業(yè)稅款中抵交，如以后一年內(nèi)未發(fā)生應納營業(yè)稅的行為，或其應納稅款不足以抵頂免稅額的，納稅人可向負責征收的稅務機關申請辦理退稅。②
     三、關于所得稅
     （一）對社會力量，包括企業(yè)單位（不含外商投資企業(yè)和外國企業(yè)）、事業(yè)單位、社會團體、個人和個體工商戶（下同），資助非關聯(lián)的科研機構和高等學校研究開發(fā)新產(chǎn)品、新技術、新工藝所發(fā)生的研究開發(fā)經(jīng)費，經(jīng)主管稅務機關審核確定，其資助支出可以全額在當年度應納稅所得額中扣除。當年度應納稅所得額不足抵扣的，不得結轉(zhuǎn)抵扣。
     非關聯(lián)的科研機構和高等學校是指，不是資助企業(yè)所屬或投資的，并且其科研成果不是唯一提供給資助企業(yè)的科研機構和高等學校。
     企業(yè)向所屬的科研機構和高等學校提供的研究開發(fā)經(jīng)費資助支出，不實行抵扣應納稅所得額辦法。
     企業(yè)等社會力量向科研機構和高等學校資助研究開發(fā)經(jīng)費，申請抵扣應納稅所得額時，須提供科研機構和高等學校開具的研究開發(fā)項目計劃、資金收款證明及其他稅務機關要求提供的相關資料，不能提供相關資料的，稅務機關可不予受理。
     （二）軟件開發(fā)企業(yè)實際發(fā)放的工資總額，在計算應納稅所得額時準予扣除。
     四、關于外商投資企業(yè)和外國企業(yè)所得稅
     外商投資企業(yè)和外國企業(yè)資助非關聯(lián)科研機構和高等學校研究開發(fā)經(jīng)費，參照《中華人民共和國外商投資企業(yè)和外國企業(yè)所得稅法》中有關捐贈的稅務處理辦法，可以在資助企業(yè)計算企業(yè)應納稅所得稅額時全額扣除。
     五、關于進出口稅收
     （一）對企業(yè)（包括外商投資企業(yè)、外國企業(yè)）為生產(chǎn)《國家高新技術產(chǎn)品目錄》的產(chǎn)品而進口所需的自用設備及按照合同隨設備進口的技術及配套件、備件。除按照國發(fā)［１９９７］３７號文件規(guī)定《國內(nèi)投資項目不予免稅的進口商品目錄》所列商品外，免征關稅和進口環(huán)節(jié)增值稅。
     （二）對企業(yè)（包括外商投資企業(yè)、外國企業(yè)）引進屬于《國家高新技術產(chǎn)品目錄》所列的先進技術，按合同規(guī)定向境外支付的軟件費，免征關稅和進口環(huán)節(jié)增值稅。
     軟件費是指進口貨物的納稅義務人為在境內(nèi)制造、使用、出版、發(fā)行或者播映該項貨物的技術和內(nèi)容，向境外賣方支付的專利費、商標費以及專有技術、計算機軟件和資料等費用。
     （三）對列入科技部、外經(jīng)貿(mào)部《中國高新技術商品出口目錄》的產(chǎn)品，凡出口退稅率未達到征稅率的，經(jīng)國家稅務總局核準，產(chǎn)品出口后，可按征稅率及現(xiàn)行出口退稅管理規(guī)定辦理退稅。
     六、科研機構轉(zhuǎn)制問題
     （一）中央直屬科研機構以及省、地（市）所屬的科研機構轉(zhuǎn)制后，自1999年至2003年5年內(nèi)，免征企業(yè)所得稅和科研開發(fā)自用土地的城鎮(zhèn)土地使用稅。
     本條所指科研機構不包括：已經(jīng)轉(zhuǎn)制和已并入企業(yè)的科研機構，以及所有從事社會科學研究
    的科研機構。
     （二）享受上述稅收優(yōu)惠政策的科研機構，需持轉(zhuǎn)制變更后的企業(yè)工商登記材料報當?shù)刂鞴芏悇諜C關，并按規(guī)定辦理有關減免稅手續(xù)。